平成26年度
・図書館本館増築・改修竣工
・総合研究棟IIの設置
・未来型太陽光発電システム研究センター・人間医工学研究開発センター廃止

平成27年度
・大学院教育学研究科教職実践開発専攻の特別支援学校コースを特別支援教育コースに名称変更
・教育学部学校教育教員養成課程社会科教育講座の法律、経済、哲学の3専攻を統合し、現代社会に名称変更
・家畜衛生地域連携教育研究センター設置
・地域減災研究センター設置
・研究推進・社会連携機構 次世代エネルギー研究センター設置
・科学技術人材育成費補助事業「ダイバーシティ研究環境実現イニシアティブ(連携型)」採択
・機器分析分野医学施設を廃止し、一元化
・金型創成技術研究センター・複合材料研究センター・みず再生技術研究推進センター廃止

平成28年度
・微生物遺伝資源保存センター(GCMR)設置
・次世代金型技術研究センター設置
・iCeMS岐阜大学サテライトや比較がんセンター等を再編し、生命の鎖統合研究センターを設置